Seit 2004 besteht zwischen "Theologie im Fernkurs" und dem Bildungswerk der Erzdiözese Köln eine Kooperationsvereinbarung über die Durchführung des Grundkurses durch das Bildungswerk. Diese Vereinbarung wurde nun in gegenseitigem Einvernehmen überprüft und auf beiderseitigen Wunsch fortgeschrieben. Zukünftig wird das Bildungswerk Köln auch den Aufbaukurs in der Erzdiözese Köln durchführen und die Prüfungen abnehmen. Bei den Prüfungen wird stets ein Vertreter von "Theologie im Fernkurs" mitwirken. Die fortgeschriebene Kooperationsvereinbarung wurde am 28. März 2011 von Monsignore Robert Kleine, Direktor der Hauptabteilung Seelsorge und 1. Vorsitzender des Bildungswerk der Erzdiözese Köln e.V., und Dr. Thomas Franz, Leiter von "Theologie im Fernkurs", in Köln unterzeichnet.